Omdat Stichting Panta Rhei het bevoegd gezag vormt van meer dan één school is er ook een Gemeenschappelijke Medezeggenschapsraad (GMR). Iedere MR is in de GMR vertegenwoordigd. Dat betekent niet dat per sé vanuit iedere school een lid in de GMR gekozen moet worden. Bevoegd gezag en MR’en kunnen afspreken dat een gekozen lid meer dan één MR of één school vertegenwoordigt. Marusha Fehling vertegenwoordigt Basisschool Essesteijn in de GMR. 

 De GMR heeft een aantal advies-en instemmingsrechten. Zaken die heel Panta Rhei betreffen (b.v. arbeidsvoorwaarden, financiën) zullen aan de GMR worden voorgelegd.